La agricultura es una actividad económica importante en la parroquia San José de Guayusa, representa un alto porcentaje en la utilización del suelo, aspecto que fue evidenciado por el equipo de trabajo de campo.

FRUTALES Y CULTIVOS.-

La mayoría de frutales y cultivos están ligados a los hábitos de los asentamientos humanos, las costumbres de consumo local tienen como fuente de su sustento el plátano, yuca, chonta, maíz, palmito, café, que lo cultivan los colonos y grupos étnicos de la zona.

Las principales especies de frutales y cultivos son los siguientes:

La parroquia San José de Guayusa cuenta con 1203,3 ha (2,38%) de cultivos diversos diseminados por toda el área de análisis; que en resumen se detalla:

a.  Los pastizales con 428 ha cultivadas  figura con el 35%, estos están distribuidos en toda el área de análisis.

b.  El café con 193 ha representa el 16% de los cultivos parroquiales

c.  El plátano con 127,8 ha representa el 11%

d.  El cacao con 116,3 ha representa el 10%, 

e.  El maíz con 94 ha constituye el 8%

f.  La yuca con 98,1 ha representa el 8%

g.  El palmito o chonta con 48,4 ha simboliza el 4%

h.  La Palma africana con 50 ha cultivadas representa el 4%

i.  La teca con 9,5 ha constituye el 1%

j.  La Balsa con 13,5 ha representa el 1%

k.  El arroz con 14 ha representa el 1%

l.  El maní con 5,8 ha constituye el 0,5%

m.  La caña de azúcar con 3,5 ha representa el 0,3%

n.  El fréjol con 1,5 ha significa el 0,2%.

Es un importante generador de riqueza a nivel parroquial, toda vez que los pastizales representan el 35% de la utilización del suelo en el concierto local. A partir de la caída en picada de los precios del café en febrero del 2001 muchos campesinos han adoptado como alternativa tumbar sus extensiones de café y convertir sus terrenos en pasto para el ganado bovino. A nivel nacional el 6% de la producción lechera proviene de la región oriental e insular y entre el Oriente y Región Insular abastecen con el 20% la demanda de la carne. Son cada vez más numerosas las organizaciones y los productores individuales dedicados a  la crianza de ganado menor para la comercialización (chanchos y pollos), como alternativa a la crisis económica, lo cual ha generado una disminución de los precios.

PASTOS.-

Los pastos destinados al ganado bovino son la principal forma de utilización del suelo y representan el 35% del total utilizado. En la mayor parte de las zonas del cantón Francisco de Orellana, se puede observar extensiones de potreros de origen antrópico, formado en gran parte por especies de gramíneas, donde predominan los siguientes pastizales: 

AGROINDUSTRIA.-

Los  únicos monocultivos  producidos  de forma intensiva  son  la  Palma Africana  y Teca. La  empresa Palmar del Río, radicada en la zona desde los años 80, ocupa aproximadamente 10.000 ha en estos cultivos, que están ubicados dentro de la parroquia Nuevo Paraíso y San José de Guayusa; sin embargo, esta representa una área de cultivo marginal con respecto a la extensión total del cultivo en el área parroquial, considerando que Palmar del río, forma parte de la Comuna Huayusa  solamente con  44 ha,  con  cultivos  de Teca.  Es importante señalar,  que el aporte y generación de empleo por la inclusión de  la fuerza laboral contratada directa por esta empresa es de 50 personas del lugar; con ingresos promedio de USD 400,00 mensuales.

La explotación petrolera desde el año 1960 hasta la fecha se ha convertido en la detonante de una  incontrolada  apertura  de kilómetros de líneas sísmicas, apertura de carreteras, caminos,  construcción de plataformas y campamentos que se orientaron a la búsqueda y explotación de petróleo.  Desde esa época a la actualidad, se ha generado un descontrolado proceso de desforestación directa. A pesar de la incorporación de nuevas tecnologías para la exploración y explotación petrolera,  a través de  plataformas multi-pozos, trochas  para sísmica y penetración  que  han reducido las extensiones deforestadas,  todavía son muy considerables sus efectos sobre la deforestación, pues a ello se ha sumado el incremento de los asentamientos humanos de colonos que han migrado y  establecido  en la zona, por la generación de empleo que ofertan estas empresas. 

Otra de las causas de la deforestación es la tala indiscriminada de los bosques, tarea que las grandes empresas llevan a efecto con equipos y maquinarias como sucede en la comuna Huayusa, en donde mediante convenio entre la comunidad y la empresa sin nombre y los respectivos permisos de entidades como el MAE y MAGAP están explotando el bosque nativo con una proyección de tala de 180 ha.

En otras comunidades como San Antonio, Atacapi, Rumipamba, Quichua Lumucha, Lumucha y todas las comunidades que están ubicadas por la ribera del río Coca, explotan la madera con fines económicos pero de una manera tradicional (selectiva).